MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021030	CGT	2	6	781079	781084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021030	CCG	2	6	781092	781097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_021030	GCA	2	6	781105	781110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_021030	GCC	2	6	781129	781134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_021030	CGC	2	6	781232	781237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_021030	A	6	6	781296	781301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021030	GC	3	6	781304	781309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_021030	ACG	2	6	781310	781315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021030	A	6	6	782828	782833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021030	CGC	2	6	785883	785888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_021030	CAA	2	6	786731	786736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_021030	CGG	2	6	786816	786821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021030	CAT	2	6	786842	786847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_021030	TCC	2	6	786882	786887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_021030	CGAC	2	8	786964	786971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_021030	CGGC	2	8	786997	787004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_021030	CGA	2	6	787111	787116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021030	GC	3	6	787181	787186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_021030	GTG	2	6	787188	787193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021030	GCG	3	9	787196	787204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_021030	GAT	2	6	787289	787294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021030	TCG	2	6	787296	787301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021030	TCGA	2	8	787317	787324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_021030	GCA	2	6	787369	787374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021030	CGT	2	6	787394	787399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021030	C	6	6	787448	787453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5027	NC_021030	CAG	2	6	787542	787547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021030	GC	3	6	787578	787583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_021030	CGC	2	6	787591	787596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_021030	GAA	2	6	787610	787615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021030	GTT	2	6	787706	787711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021030	GAT	2	6	787787	787792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021030	GCG	2	6	787805	787810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_021030	TGA	2	6	787873	787878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021030	CCG	2	6	787920	787925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_021030	AGG	3	9	788055	788063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021030	A	6	6	788074	788079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021030	GC	3	6	788090	788095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_021030	GCGT	2	8	788165	788172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_021030	CGT	2	6	788209	788214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_021030	GCC	2	6	788217	788222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_021030	GGC	2	6	788240	788245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021030	CGG	2	6	788263	788268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021030	GAT	2	6	788314	788319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021030	CAT	2	6	788395	788400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021030	GC	3	6	788424	788429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_021030	GCA	2	6	788487	788492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_021030	CGTGAC	2	12	788494	788505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_021030	CGC	2	6	788527	788532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_021030	CGG	2	6	788538	788543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021030	ATC	2	6	788546	788551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021030	GCT	2	6	788560	788565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021030	CG	3	6	788631	788636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_021030	TGG	2	6	788661	788666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021030	CAT	2	6	788692	788697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021030	TGC	2	6	788706	788711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_021030	GTG	2	6	788735	788740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021030	CGC	2	6	788782	788787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_021030	GTC	2	6	788825	788830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021030	GCC	2	6	788858	788863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_021030	ATA	2	6	788864	788869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021030	A	6	6	788919	788924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021030	AAAT	2	8	788962	788969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021030	CTC	2	6	788976	788981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_021030	A	6	6	789007	789012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021030	CCG	2	6	789020	789025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_021030	GGA	2	6	790533	790538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021030	TCG	2	6	790574	790579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021030	GAC	2	6	790582	790587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021030	TCG	2	6	790616	790621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_021030	CGG	2	6	790622	790627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021030	AGA	2	6	790628	790633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021030	AGG	2	6	790664	790669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021030	CGA	2	6	790710	790715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_021030	ATG	2	6	790729	790734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_021030	GAG	2	6	790735	790740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021030	AAC	2	6	790741	790746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021030	CTG	2	6	790753	790758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_021030	CTG	2	6	790786	790791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_021030	CAC	2	6	790803	790808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_021030	CCGCG	2	10	790827	790836	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5082	NC_021030	CG	3	6	790843	790848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_021030	CGAAA	2	10	790860	790869	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_021030	GCC	2	6	790883	790888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_021030	GC	5	10	790908	790917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5088	NC_021030	GGC	2	6	790953	790958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_021030	GC	3	6	790997	791002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_021030	CTG	2	6	791050	791055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_021030	A	7	7	791064	791070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021030	ATC	2	6	791083	791088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021030	GAG	2	6	791122	791127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021030	ATC	2	6	791131	791136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021030	TCG	2	6	791281	791286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_021030	GCG	2	6	791327	791332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021030	AGC	2	6	791333	791338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_021030	GAT	2	6	791355	791360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021030	CGT	2	6	791382	791387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_021030	CAA	2	6	791424	791429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_021030	CGA	2	6	791502	791507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_021030	CAT	2	6	791532	791537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_021030	TGA	2	6	791567	791572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021030	CAA	2	6	791574	791579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_021030	CGGGC	2	10	791590	791599	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5107	NC_021030	CGA	2	6	791622	791627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021030	CAC	2	6	791698	791703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_021030	AGCGG	2	10	792703	792712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5110	NC_021030	AGA	2	6	792759	792764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021030	CCG	2	6	793595	793600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_021030	CGC	2	6	793607	793612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_021030	AATAA	2	10	793674	793683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021030	TCC	2	6	793702	793707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_021030	GAA	2	6	793730	793735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021030	CCGCG	2	10	793791	793800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5117	NC_021030	CATA	2	8	793813	793820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_021030	GAAGT	2	10	793884	793893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021030	TAT	2	6	793928	793933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021030	GAT	2	6	793965	793970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021030	T	6	6	793988	793993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021030	AACCC	2	10	794002	794011	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5123	NC_021030	AAC	2	6	794442	794447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021030	GAT	2	6	794474	794479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021030	AG	3	6	794492	794497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021030	CCT	2	6	794518	794523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_021030	ATA	2	6	797225	797230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021030	AAT	2	6	797231	797236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021030	TTTC	2	8	797264	797271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_021030	ACAA	2	8	797282	797289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_021030	TATT	2	8	797373	797380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021030	A	7	7	797470	797476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021030	GCC	2	6	797479	797484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_021030	GGC	2	6	797489	797494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_021030	N	734	734	812995	813728	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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